Veľmi dobré hodnotenie získala Škoda Rapid od Euro NCAP v oblasti ochrany dospelých pasažierov, kde dosiahol 94 % z maxima možných bodov. Skvele si Rapid viedol ako pri čelnom, tak bočnom náraze. Dokonca aj z náročného testu bočného nárazu do stĺpa vyšli testovacie figuríny takmer nedotknuté.
Škoda Rapid nezaostáva ani v hodnotení bezpečnosti detí. Vozidlo získalo maximálny možný počet bodov v dynamických testoch za ochranu trojročných detí. V celkovom súčte si Rapid za bezpečnosť detí vyslúžil 80 % z maximálneho možného počtu bodov.
Pozitívne zhodnotil EuroNCAP na modeli Rapid tiež ochranu chodcov. Za vlastnosti nárazníka pri náraze získal model bodové maximum. Nárazník je konštruovaný tak, aby v prípade kolízie bol maximálne redukovaný jeho účinok na nohy chodcov. Najlepšie hodnotenie vykazuje aj kapota, a to predovšetkým v miestach, kam by mohla naraziť hlava dieťaťa.
Tiež osadenie novinky elektronickými asistenčnými systémami prispelo k hodnoteniu piatimi hviezdami. Vyzdvihnutá bola najmä elektronická kontrola stability ESC a signalizácia nezapnutých bezpečnostných pásov na sedadlách vodiča a spolujazdca, ktoré sú v krajinách EÚ súčasťou štandardnej výbavy.